Letadlo vzlétlo 2. května z hlavního města Rovníkové Guineje Malabo v 19:51 místního času už za tmy a navíc špatného počasí. Piloti kvůli tomu lehce upravili směr a dosáhli řádné letové výšky, která se pohybuje kolem 13 tisíc stop (zhruba 3900 metrů). Problém však je, že hora, krá je zároveň aktivním vulkánem, měří 4090 metrů a hrozila tak srážka.

Na riziko upozornil alarm, který se spouští v případě příliš nízké letové hladiny. Piloti okamžitě zareagovali a letadlo zvedli do bezpečné výšky, aby střetu zabránili. Podle mluvčího Air France jsou v podobných manévrech pravidelně školeni. Nikomu na palubě se nich nestalo, cestující si manévru údajně ani nevšimli. 

Incident vyšetřuje francouzská agentura pro vyšetřování leteckých nehod. Zatím je klasifikovaný jako "řízený let směrem k terénu". Do té doby, než se událost vyšetří, byli piloti postaveni mimo službu a letecká společnost nezávisle zahájila vlastní vyšetřování.