Obvodní státní zastupitelství pro Prahu 1 ho společně se čtveřicí dalších lidí začalo stíhat kvůli zneužití pravomoci veřejného činitele, nadržování, podplácení či nepřímému úplatkářství. Zákon měl porušit ve svém předchozím zaměstnání, kdy působil jako vyšetřovatel nehod u dopravní policie. 

"Po zvážení všech okolností jsem se rozhodl rezignovat na funkci ředitele odboru dopravních přestupků," uvedl Bernat. Dodal, že se jednání, ze kterého je obviněn, nedopustil. Nechce prý ale, aby "negativní mediální kampaň", která je vůči němu vedena, byla spojována s magistrátem. 

Bernata a jeho kolegu navrhla obvinit inspekce policie na konci března. Policisté údajně chtěli vzít úplatek s tím, že nebudou stíhat člověka, který při dopravní nehodě těžce zranil chodkyni a z místa havárie ujel. 

Bernata zadržela policie přímo na pražském magistrátu. Do doby uzavření celé záležitosti poté dostal podle mluvčího magistrátu Jiřího Wolfa dovolenou a řízením odboru byl pověřen vedoucí oddělení sekretariátu dopravních přestupků Oldřich Mařík. 

Odbor dopravních přestupků podle Mladé fronty Dnes čelí navíc podezření, že pod Bernatovým vedením zajišťoval vlivným lidem, aby se vyhnuli například ztrátě řidičského průkazu. Šlo údajně o systém "omluvenek", jejichž pomocí se projednání přestupku odsouvalo tak dlouho, až byl po roce promlčen. Bernat tehdy tyto zprávy popřel. Podle deníku ale poté sezval úředníky a vyšetřoval, kdo informace vynesl.