Prezidentský finalista, který skončil za Milošem Zemanem (24,21 procent) jako druhý v pořadí s 23,40 procenty hlasů, se na svém oficiálním webu vyjádřil k prohlášení neúspěšně kandidujícího Jana Fischera (16,35 procent), jehož kritika směřovala k tomu, že Schwarzenberg zdiskreditoval český stát svým výrokem označujícího prezidenta Beneše za válečného zločince. Fischer tak otevřeně vyjádřil svou podporu Zemanovi.