Některá trestní stíhání musela být kvůli nečinnosti soudu zastavena z důvodu promlčení. Vaněk se bránil tím, že chomutovský soud byl katastroficky přetížený a nedostatečně obsazený. Hned při nástupu dostal asi 160 starých kauz. 

Podle předsedkyně kárného senátu Ludmily Valentové sice Vaněk porušil povinnosti soudce, nikoliv však vlastní vinou. Příčinou byla nepřiznivá situace u soudu. "Jinak pracoval zodpovědně, mnoho věci stihnul vyřešit a má dobré hodnocení," uvedla Valentová. 

Ministerstvo spravedlnosti vypočítalo osm případů, v nichž vinou Vaňka došlo k průtahům. Utrpěl tím kredit justice, uvedl u soudu zástupce ministerstva, podle něhož nešlo o nijak složité či závažné kauzy.

Nadřízení a kolegové se však postavili za Vaňka. Podle hodnocení vedení soudu pracuje dobře. Jeho působení je přínosem i podle soudcovské rady. Vaněk se prý při nástupu musel vypořádat s důsledky dlouhodobé neobsazenosti a byl si vědom toho, že nastupuje k jednomu z nejvíce zahlcených soudů.

Vaňka se zastali také kolegové z trestního úseku, a to způsobem, který je v kárných řízeních neobvyklý. Pokud je vinen on, pak my všichni, uvedli v dopise adresovaném Nejvyššímu správnímu soudu. Kárná žaloba je prý uvedla do "němého úžasu", Vaněk prý pracuje na "hranici lidských možností". Práce na přetíženém chomutovskému soudu údajně tamní soudce připravila o iluze a uvrhla do "hlubiny beznaděje".

Nejvyšší správní soud zjistil, že okamžitě při nástupu v prosinci 2003 dostal Vaněk na stůl více než 160 spisů v různé fázi rozpracování. V následujícím roce mu přibylo více než 300 případů. Až do letoška postupně snižuje počet restů. V podobné situaci jsou i ostatní chomutovští soudci. "Personální obsazení bylo zcela nedostatečné," uvedl Vaněk. Podle něj by muselo do Chomutova na rok přijít 40 soudců, aby se podařilo vyřešit všechny starší kauzy.

Chomutovský soud měl problémy prakticky již od roku 1989. V minulosti dokonce opakovaně došlo k tomu, že některé chomutovské kauzy musely řešit jiné soudy, například obvodní soudy v Praze. Bývalý pražský advokát Vaněk uvedl, že mu ministerstvo při nástupu do funkce slibovalo každodenní dopravu z Prahy do Chomutova, případně náhradu nákladů za ubytování. "K ničemu z toho nedošlo," uvedl Vaněk. Ve srovnání se soudci, kteří pracují ve svých domovských městech, podle svých výpočtů přišel kvůli výdajům za cestování a bydlení o 750 tisíc korun. 

Ministerstvo spravedlnosti navrhovalo, aby soud snížil Vaňkovi plat na šest měsíců o 15 procent. Podle NSS ale takový postih není namístě. Valentová v odůvodnění rozhodnutí NSS mimo jiné připomněla, že Vaněk přišel justici dobrovolně pomoci, a to za nepříznivých okolností. Je prý obtížné přebírat starší případy. "Některé dostal už rozpracované, třeba po dvou letech, musel se s nimi seznámit," uvedla Valentová. 

Přetížení je problémem u mnoha českých soudů a pravidelně zaznívá při kárných řízeních jako hlavní argument soudců, jimž hrozí trest za průtahy. Kárné senáty ale ne vždy tyto okolnosti zohlední.