Českou prioritou ve vztahu k Evropské unii je podle Fischera ratifikace lisabonské smlouvy. 

"Zásadní priorita, pokud jde o evropskou politiku a o vztah vůči unii, je dokončení ratifikace nebo přesvědčení našich evropských kolegů, že ten proces (ratifikace) bude tady zvládnut," řekl premiér. "Protože na základě toho se bude na té říjnové (Evropské) radě vlastně rozhodovat, v jakém formátu bude komise vlastně vytvářena," doplnil.

Pokud nebude lisabonská smlouva ratifikována, Evropskou komisi bude nutné sestavit podle smlouvy z Nice. Ta ale na rozdíl od lisabonské smlouvy stanovuje, že komise musí mít méně členů, než je členských zemí unie. V minulosti zaznívaly obavy, že by o komisaře přišlo právě Česko, protože je poslední zemí, která ještě lisabonskou smlouvu neratifikovala. 

Politici se zatím na jméně českého komisaře neshodli. ČSSD trvá na dosavadním komisaři Vladimíru Špidlovi, ODS navrhuje svého senátora a bývalého ministra pro evropské záležitosti Alexandra Vondru. Dalšími kandidáty jsou Jan Švejnar za Stranu zelených, Pavel Svoboda za KDU-ČSL a Vladimír Remek za KSČM. Konečné slovo při výběru má vláda. 

Evropský summit se uskuteční 29. a 30. října. Jen dva dny před ním bude o souladu lisabonské smlouvy s českou ústavou rozhodovat Ústavní soud. Prezident Václav Klaus, jehož podpis pod dokumentem chybí, ale podmínil ratifikaci smlouvy výjimkou pro Česko z listiny základních práv EU. Prezident se obává možných nároků sudetských Němců.

Slovenský premiér Robert Fico prohlásil, že Slovensko bude výjimku pro Prahu blokovat, pokud mu nebude poskytnuta také.