Návrh se příliš nelíbí prezidentovi NKÚ Františku Dohnalovi. Vadí mu, že neobsahuje formulaci, podle níž je úřad nezávislý orgán. 

Novela zpřesňuje, co může úřad nově kontrolovat. Podle dosavadního znění ústavy mohl prověřovat hospodaření se státním majetkem a plnění státního rozpočtu. Nově bude moci kontrolovat i příjmy a výdaje podle státního rozpočtu a návrh státního závěrečného účtu. Bude moci také kontrolovat zákonnost hospodaření s majetkem územních samosprávných celků a příjmů a výdajů podle jejich rozpočtů. S návrhem přišli poslanci ODS a ČSSD. 

Server Aktuálně.cz uvedl, že navrhovaná novela by poslancům také umožnila, aby do kolegia úřadu, tedy jeho širšího vedení, sami navrhovali své kandidáty. Dosud je podle zákona o NKÚ volí poslanci na návrh prezidenta úřadu.

Předseda ústavně právního výboru Marek Benda (ODS) ale ujistil poslance, že nebylo záměrem předkladatelů změnit pravidla tak, aby jim kandidáty do kolegia navrhoval někdo jiný než prezident NKÚ. "Nechtěli jsme měnit působnost Nejvyššího kontrolního úřadu ani postavení jeho představitelů," prohlásil Benda. ¨

Podle šéfa ODS Mirka Topolánka je rozšíření pravomocí NKÚ na obce a kraje důležitým protikorupčním signálem. "I na těchto úrovních může, a proto i zřejmě dochází k uplácení, které je v současnosti i díky té nemožnosti kontroly méně viditelné," řekl.

ODS podle něj v rámci protikorupčních opatření podporuje také vytvoření generální inspekce bezpečnostních sborů nebo zavedení trestní odpovědnosti právnických osob a odpovědnosti za škodu při správě veřejného majetku.

Podle exministra spravedlnosti Jiřího Pospíšila ještě bude sněmovní ústavně právní výbor zvažovat připomínky vlády k návrhu a některé drobné úpravy. Například, zda má být v ústavě napsáno, že NKÚ může kontrolovat, nebo zda prostě kontroluje. To by pak podle něj omezilo spekulace, zda úřad musí nebo jen může podle svého uvážení kamsi zamířit na kontrolu. Upozornil také, že zcela nově se do ústavy zařadí omezení, které stanoví, že prezidentem i viceprezidentem úřadu nemůže být nikdo zvolen víc než dvakrát. 

Z ústavy by měla zmizet věta, že "Nejvyšší kontrolní úřad je nezávislý orgán". Místo ní se vkládá jiná, která za výčtem kontrolních pravomocí dodává, že "nezávislost výkonu těchto působností nesmí nikdo ohrožovat". To se ale nelíbí Dohnalovi. "Nová pasáž už neobsahuje slůvko, že je to nezávislý kontrolní úřad," upozornil již v polovině ledna. 

Výhrady má také poslanec KDU-ČSL Ludvík Hovorka. "Obávám se, abychom tady nevytvořili další 'náhubkový zákon', tentokrát na Nejvyšší kontrolní úřad," řekl poslancům. Benda ale popřel, že by předkladatelé chtěli do nezávislosti úřadu zasáhnout. Stejně se vyjádřil i předseda poslanců ČSSD Bohuslav Sobotka. 

Dohnal také již dříve upozornil, že úřad by kontroloval pouze to, zda úřady utrácely peníze v souladu se zákonem. Už by nekontroloval, zda peníze vynaložily efektivně a zda se nějaký projekt nedal pořídit levněji. K projednávání poslanci Dohnala nepřizvali, protože jde o poslanecký návrh, sdělila na dotaz mluvčí úřadu Radka Burketová. 

Změna pravomocí NKÚ je již 11. pokus o změnu ústavy, který v tomto volebním období dorazil do sněmovny. Úspěšný byl zatím jen jeden, a to když poslanci loni schválili senátní návrh, který měl umožnit prezidentu republiky, aby kvůli volbám rozpustil sněmovnu.