K vstupu LS v platnost už schází jen podpis českého prezidenta Václava Klause. Ten je v Evropě terčem široké kritiky kvůli na poslední chvíli vznesenému požadavku na trvalou výjimku z Listiny základních práv EU pro Českou republiku. Předseda české vlády Jan Fischer ale řekl, že věří, že "v dohledné době" bude ratifikace smlouvy dokončena i Praze. Kaczyński - kdysi velký kritik LS - před podpisem řekl, že smlouva znamená pro EU "změnu kvality", a vyslovil přesvědčení, že "tento velký experiment bude úspěšný". Podpisu byli přítomni předseda Evropské komise José Manuel Barroso a švédský premiér Fredrik Reinfeldt, jehož země teď unii předsedá a který vyzval Klause, aby dokument podepsal tak, aby bylo možné ho začít uplatňovat od 1. ledna. Klaus lisabonskou smlouvu odmítá. Teď mu důvod ji nepodepsat na nějakou dobu poskytuje její posuzování českým ústavním soudem. V pátek navíc prezident vznesl požadavek na výjimku z Listiny základních práv, protože se obává možnosti prolomení takzvaných Benešových dekretů a uplatňování majetkových nároků odsunutých sudetských Němců. Během dlouhého projednávání dokumentu o tomto aspektu nemluvil. Premiér Fischer už v pátek prohlásil, že vláda možné dopady lisabonské smlouvy zvážila a riziko eventuálního prolomení Benešových dekretů nepovažuje za reálné. Mluvčí sudetských Němců Berndt Posselt označil Klausův postup za cynickou hru. Klaus podle něho ví, že Listina základních práv EU žádné právní důsledky pro majetkové poměry v členských zemích unie nevytváří. Jinde v Evropě byl Klausův požadavek vesměs označován za zdržovací taktiku. Maďarský premiér Gordon Bajnai řekl, že je naprosto kontraproduktivní a brání ekonomickému oživení Evropy. Britský list The Guardian napsal, že Klaus popudil Brusel, Berlín a Paříž, a podle The Times evropští představitelé považují Klausovy požadavky jen za zdržování s cílem poškodit instituci, kterou nenávidí. Podle francouzského Le Figaro jde o demagogický prostředek proti evropské integraci, která se Klausovi hnusí. Tento deník ale napsal, že Klausův požadavek není nesplnitelný - záruky dané Irsku před nedávným novým referendem o smlouvě by prý mohly být schůdným řešením i pro Čechy. Řada českých politiků počínaje premiérem uvítala polský podpis. Podle sociálnědemokratického předsedy zahraničního výboru Poslanecké sněmovny Jana Hamáčka ovšem polský podpis staví ČR do plného světla jako poslední zemi, která ještě dokument neratifikovala. Předseda Zelených Ondřej Liška označil tuto situaci za další ostudu pro republiku. Ani podle mluvčího ODS Martina Kupky prodlužování ratifikace České republice neprospívá. ODS je však prý přesvědčena, že Klaus po kladném výroku ústavního soudu smlouvu podepíše, ať už s vládou ohledně svých nových požadavků nalezne shodu nebo ne. K okamžitému podpisu prezidenta vyzval předseda KDU-ČSL Cyril Svoboda. Vůdce TOP 09 Karel Schwarzenberg řekl, že "doufá, že to konečně podepíše" i Klaus. Český list Právo napsal, že Klaus postavil ČR do nejhoršího možného světla. Neváhá prý poškozovat Evropu, a to ubožáckým, provinčním způsobem - házením klacků pod nohy či zlomyslnými ranami do zad.