V pondělí ho ve funkci nahradil dosavadní ředitel Správy národního parku Podyjí Tomáš Rothröckl. 

Mluvčí ministerstva Petra Roubíčková informovala, že Pelc odešel na vlastní žádost a nadále bude pracovat jako ředitel Agentury ochrany přírody a krajiny (AOPK), odkud v září 2007 do funkce náměstka ministra přišel. 

"Jsem rád, že František Pelc zůstává ve funkci ředitele AOPK, a resort tak nepřijde o jeho zkušenosti v oblasti ochrany přírody, kterých si mimořádně vážím, stejně tak jako osobnosti Františka Pelce," uvedl ministr Jan Dusík. Rothröckla vybral po zkušenostech, které se ním měl jako s šéfem Národního parku Podyjí. 

Dosavadní ředitel AOPK František Pojer zůstává v agentuře ve vedení útvaru dozoru nad národními přírodními rezervacemi, řízením Správy národního parku Podyjí je dočasně pověřen náměstek ředitele a vedoucí odboru péče o les Petr Vančura.